Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CNPPD1Q9BV87 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CNPPD1Q9BV87 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms