Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
SPOCK3Q9BQ16 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms