Protein–RNA interactions for Protein: Q96T59

CDRT15, CMT1A duplicated region transcript 15 protein, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDRT15Q96T59 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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CDRT15Q96T59 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CDRT15Q96T59 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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