Protein–RNA interactions for Protein: Q96RJ3

TNFRSF13C, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF13CQ96RJ3 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
TNFRSF13CQ96RJ3 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms