Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SAMD8Q96LT4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms