Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLMNQ96JQ2 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLMNQ96JQ2 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms