Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
HPS3Q969F9 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms