Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SCG3Q8WXD2 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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