Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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FAM46DQ8NEK8 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM46DQ8NEK8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM46DQ8NEK8 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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