Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ATG16L2Q8NAA4 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ATG16L2Q8NAA4 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms