Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RNF148Q8N7C7 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RNF148Q8N7C7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms