Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CLIP4Q8N3C7 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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CLIP4Q8N3C7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CLIP4Q8N3C7 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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