Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CNTN4Q8IWV2 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN4Q8IWV2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN4Q8IWV2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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CNTN4Q8IWV2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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CNTN4Q8IWV2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CNTN4Q8IWV2 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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