Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
P3H3Q8IVL6 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
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