Protein–RNA interactions for Protein: Q6SA08

TSSK4, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK4Q6SA08 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TSSK4Q6SA08 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSSK4Q6SA08 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms