Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRC8EQ6NSJ5 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms