Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
GARNL3Q5VVW2 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
GARNL3Q5VVW2 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms