Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ALFQ53S48 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms