Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC9

EIPR1, EARP-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIPR1Q53HC9 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
EIPR1Q53HC9 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
EIPR1Q53HC9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms