Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
GPAT3Q53EU6 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms