Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCDC38Q502W7 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms