Protein–RNA interactions for Protein: Q49A88

CCDC14, Coiled-coil domain-containing protein 14, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC14Q49A88 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC14Q49A88 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms