Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SKOR2Q2VWA4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms