Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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NRF1Q16656 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NRF1Q16656 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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