Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NTRK3Q16288 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms