Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CNGA3Q16281 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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