Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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TAF1AQ15573 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
TAF1AQ15573 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TAF1AQ15573 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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TAF1AQ15573 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF1AQ15573 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms