Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
TLR1Q15399 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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