Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 RTL10-201ENST00000328554 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.418e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.438e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 G2E3-202ENST00000438909 2334 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.498e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF44-208ENST00000600003 2051 ntTSL 211.98□□□□□ -0.498e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 LUC7L-203ENST00000397780 1335 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.58e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 LUC7L-205ENST00000418978 989 ntTSL 511.7□□□□□ -0.548e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 LUC7L-210ENST00000430864 695 ntTSL 511.63□□□□□ -0.558e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF44-203ENST00000356109 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.24□□□□□ -0.618e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 KHNYN-204ENST00000556255 2198 ntTSL 211.11□□□□□ -0.638e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 G2E3-210ENST00000552488 786 ntTSL 310.91□□□□□ -0.668e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF44-201ENST00000354656 517 ntTSL 310.56□□□□□ -0.728e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 KHNYN-203ENST00000554268 760 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.738e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 RTL10-203ENST00000407472 6523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.768e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF518A-201ENST00000316045 7277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.998e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF44-204ENST00000393337 3236 ntTSL 1 (best)8.85□□□□□ -0.998e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TRIM25-203ENST00000570473 498 ntTSL 38.46□□□□□ -1.068e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 POLQ-201ENST00000264233 8775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.088e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 BCR-214ENST00000487679 231 ntTSL 1 (best)7.93□□□□□ -1.148e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.238e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF518A-208ENST00000563195 1594 ntTSL 37.23□□□□□ -1.258e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 POLQ-204ENST00000621776 9055 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.348e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF518A-207ENST00000539666 485 ntTSL 45.4□□□□□ -1.548e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 G2E3-203ENST00000544007 1003 ntTSL 25.38□□□□□ -1.558e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 CELF1-206ENST00000422993 553 ntTSL 54.78□□□□□ -1.648e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF518A-203ENST00000478086 1579 ntTSL 1 (best)4.74□□□□□ -1.658e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.758e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 G2E3-209ENST00000550944 565 ntTSL 23.99□□□□□ -1.778e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.238e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 FAM20A-203ENST00000590074 1642 ntTSL 220.22■□□□□ 0.833e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.363e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 RELA-207ENST00000526257 215 ntTSL 1 (best)4.27□□□□□ -1.732e-13■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.342e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.442e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-202ENST00000393785 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-214ENST00000480832 574 ntTSL 35.76□□□□□ -1.492e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-213ENST00000479879 565 ntTSL 55.34□□□□□ -1.552e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ZBTB20-219ENST00000491500 559 ntTSL 44.06□□□□□ -1.762e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.233e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SLC20A2-201ENST00000342228 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.373e-8■■■□□ 18
PCBP2Q15366 MICA-210ENST00000616296 2260 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.296e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 HCP5-201ENST00000414046 2658 ntTSL 4 BASIC8.12□□□□□ -1.116e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 MBD5-223ENST00000637308 1072 ntTSL 510.64□□□□□ -0.717e-16■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ST3GAL1-207ENST00000521180 6951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-9■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.882e-9■■■□□ 18
PCBP2Q15366 ATXN2L-225ENST00000570200 3635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.369e-9■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PRKCA-201ENST00000284384 2718 ntTSL 58.19□□□□□ -1.12e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 PRKCA-202ENST00000413366 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.242e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 BCAR1-210ENST00000561970 594 ntTSL 427.68■■■□□ 2.026e-7■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.452e-6■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.056e-13■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TPM3-219ENST00000509409 1248 ntTSL 214.2□□□□□ -0.146e-13■■■□□ 18
PCBP2Q15366 TPM3-201ENST00000271850 1219 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.16e-13■■■□□ 18
PCBP2Q15366 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.011e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.048e-8■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 GPC3-201ENST00000370818 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.48e-8■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-222ENST00000630907 889 ntTSL 524.98■■□□□ 1.591e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-213ENST00000626793 733 ntTSL 520.73■□□□□ 0.911e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-208ENST00000625681 654 ntTSL 520.73■□□□□ 0.911e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-218ENST00000629252 1112 ntTSL 518.61■□□□□ 0.571e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-215ENST00000628267 779 ntTSL 518.36■□□□□ 0.531e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-214ENST00000627018 474 ntTSL 317.66■□□□□ 0.421e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.321e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.191e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.261e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.511e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.621e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-219ENST00000629886 436 ntTSL 34.58□□□□□ -1.681e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.751e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 UBE3A-216ENST00000628733 706 ntTSL 53.37□□□□□ -1.871e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.144e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-206ENST00000471994 769 ntTSL 59.33□□□□□ -0.924e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-201ENST00000295930 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.944e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-215ENST00000611884 1738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.944e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-205ENST00000471911 931 ntTSL 28.76□□□□□ -1.014e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-210ENST00000480119 1335 ntTSL 58.54□□□□□ -1.044e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-202ENST00000312179 1443 ntTSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.054e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-203ENST00000464171 2411 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.214e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-212ENST00000482822 792 ntTSL 26.21□□□□□ -1.424e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.554e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 SMARCD1-207ENST00000549526 401 ntTSL 57.98□□□□□ -1.136e-7■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.453e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ERCC2-201ENST00000391941 2871 ntTSL 1 (best)17.54■□□□□ 0.43e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ERCC2-204ENST00000391945 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.42e-9■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-207ENST00000571710 2013 ntTSL 1 (best)20.15■□□□□ 0.822e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-202ENST00000263084 557 ntTSL 318.86■□□□□ 0.612e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-205ENST00000570867 2265 ntTSL 218.7■□□□□ 0.582e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-212ENST00000575162 657 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-208ENST00000572214 946 ntTSL 517.33■□□□□ 0.362e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-210ENST00000572684 2607 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-209ENST00000572248 535 ntTSL 216.22■□□□□ 0.192e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.172e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 DPH1-217ENST00000607788 775 ntTSL 514.72□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 PAH-215ENST00000553106 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.822e-9■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.242e-9■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-6■■■□□ 17.9
PCBP2Q15366 ACTN1-202ENST00000376839 2824 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.332e-6■■■□□ 17.9
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