Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NCAPHQ15003 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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