Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TRIM25Q14258 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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