Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2H3Q13889 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms