Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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GTF2H2Q13888 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
GTF2H2Q13888 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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