Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3B2Q13367 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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