Protein–RNA interactions for Protein: Q13200

PSMD2, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD2Q13200 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PSMD2Q13200 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PSMD2Q13200 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms