Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
STRN3Q13033 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
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