Protein–RNA interactions for Protein: Q12988

HSPB3, Heat shock protein beta-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB3Q12988 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
HSPB3Q12988 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
HSPB3Q12988 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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