Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GTF2BQ00403 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
GTF2BQ00403 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms