Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SIM1P81133 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SIM1P81133 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIM1P81133 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SIM1P81133 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms