Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SNRPNP63162 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SNRPNP63162 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms