Protein–RNA interactions for Protein: P57723

PCBP4, Poly(rC)-binding protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP4P57723 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PCBP4P57723 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms