Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TAF6P49848 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TAF6P49848 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TAF6P49848 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms