Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PIK3CBP42338 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PIK3CBP42338 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms