Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GRIA2P42262 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms