Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SFNP31947 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SFNP31947 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SFNP31947 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SFNP31947 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms