Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTPRMP28827 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms