Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
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HOXD10P28358 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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HOXD10P28358 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HOXD10P28358 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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HOXD10P28358 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HOXD10P28358 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
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