Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PSMA4P25789 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms