Protein–RNA interactions for Protein: P25788

PSMA3, Proteasome subunit alpha type-3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA3P25788 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PSMA3P25788 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms