Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
APCP25054 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
APCP25054 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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APCP25054 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
APCP25054 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
APCP25054 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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